Serviceeinheit CRISPR-Screening 

Wir bieten Zugang zu einer hochmodernen Plattform für funktionelles Genomscreening mit CRISPR-Cas9. 

Mit dem CRISPR-Screening können leistungsfähige und robuste Daten zur Identifizierung neuartiger Gene und Stoffwechselwege gewonnen werden, die Einblicke in die Wirkungsmechanismen von Arzneimitteln, Giftstoffen oder Krankheitserregern ermöglichen.

Die CRISPR-Screening Serviceeinheit schult Forschende in Screening-Ansätzen, leitet sie bei der Entwicklung von Screens an und liefert detaillierte Protokolle für alle Aspekte des Screening-Prozesses.

Unser Ziel ist es, Forschende in die Lage zu versetzen, ein hochwertiges CRISPR-Cas9-Screening durchzuführen, ohne dass sie die Technik selbst entwickeln müssen. Zu diesem Zweck bietet die Core Facility detaillierte Schulungen für die folgenden Screening-Schritte an:

  • Optimierung der Bedingungen für die lentivirale Transduktion
  • Festlegung von Bedingungen für die Antibiotikaselektion
  • Evaluierung von Screening-Behandlungen
  • Erzeugung/Validierung von Cas9-exprimierenden Zelllinien (optional, abhängig von der Wahl der Screening-Bibliothek)
  • Optimierung des Screening-Readouts
  • Durchführung von Massen-Screens
  • Aufbereitung von Proben für das next-generation sequencing.

Die CRISPR-Screening-Serviceeinheit bereitet die wichtigsten Screening-Reagenzien vor und führt Qualitätskontrollen durch. Die Reagenzien werden als validierte, hochtitrige lentivirale Bestände bereitgehalten. Insbesondere hält die Serviceeinheit Gold-Standard-Pool-Bibliotheken für das CRISPRko-, CRISPRi- oder CRISPRa-Screening und Cas9-Expressionssysteme vor. Forschende können zwischen einer Vielzahl von genomweiten oder Teilbibliotheken wählen. Alternativ können auf Anfrage auch maßgeschneiderte oder kundenspezifische Leitbibliotheken in der Einrichtung zusammengestellt werden.

Schließlich arbeitet die CRISPR-Screening-Serviceeinheit eng mit den FACS & Mikroskopie- und Bioinformatik-Serviceeinheiten zusammen, was erstens ein Screening mit komplexeren Phänotypen über die Zelllebensfähigkeit hinaus ermöglicht (z. B. durch die Kombination von gepooltem CRISPR-Screening mit Hochdurchsatz-Zellsortierung zum Nachweis von Veränderungen bei Reportern oder Biomarkern) und zweitens die Screening-Datenanalyse unterstützt.

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