Publications

Ayata, P.; Crowley, J. M.; Challman, M. F.; Sahasrabuddhe, V.; Gratuze, M.; Werneburg, S.; Ribeiro, D.; Hays, E. C.; Durán-Laforet, V.; Faust, T. E. et al.; Hwang, P.; Mendes Lopes, F.; Nikopoulou, C.; Buchholz, S.; Murphy, R. E.; Mei, T.; Pimenova, A. A.; Romero-Molina, C.; Garretti, F.; Patel, T. A.; De Sanctis, C.; Ramirez Jimenez, A. V.; Crow, M.; Weiss, F. D.; Ulrich, J. D.; Marcora, E.; Murray, J. W.; Meissner, F.; Beyer, A.; Hasson, D.; Crary, J. F.; Schafer, D. P.; Holtzman, D. M.; Goate, A. M.; Tarakhovsky, A.; Schaefer, A.: Lymphoid gene expression supports neuroprotective microglia function. Nature (2025)

Faust, T. E.; Lee, Y.-H.; O’Connor, C. D.; Boyle, M. A.; Gunner, G.; Durán-Laforet, V.; Ferrari, L. L.; Murphy, R. E.; Badimon, A.; Sakers, K. et al.; Eroglu, C.; Ayata, P.; Schaefer, A.; Schafer, D. P.: Microglia-astrocyte crosstalk regulates synapse remodeling via Wnt signaling. Cell (2025)

Faust, T. E.; Feinberg, P. A.; O’Connor, C.; Kawaguchi, R.; Chan, A.; Strasburger, H.; Frosch, M.; Boyle, M. A.; Masuda, T.; Amann, L. et al.; Knobeloch, K.-P.; Prinz, M.; Schaefer, A.; Schafer, D. P.: A comparative analysis of microglial inducible Cre lines. Cell Reports 42, 113031, p. 113031 (2023)

Hashimoto, A.; Kawamura, N.; Tarusawa, E.; Takeda, I.; Aoyama, Y.; Ohno, N.; Inoue, M.; Kagamiuchi, M.; Kato, D.; Matsumoto, M. et al.; Hasegawa, Y.; Nabekura, J.; Schaefer, A.; Moorhouse, A. J.; Yagi, T.; Wake, H.: Microglia enable cross-modal plasticity by removing inhibitory synapses. Cell Reports 42, 112383, p. 112383 (2023)

Ralvenius, W. T.; Mungenast, A. E.; Woolf, H.; Huston, M. M.; Gillingham, T. Z.; Godin, S. K.; Penney, J.; Cam, H. P.; Gao, F.; Fernandez, C. G. et al.; Czako, B.; Lightfoot, Y.; Ray, W. J.; Beckmann, A.; Goate, A. M.; Marcora, E.; Romero-Molina, C.; Ayata, P.; Schaefer, A.; Gjoneska, E.; Tsai, L.-H.: A novel molecular class that recruits HDAC/MECP2 complexes to PU.1 motifs reduces neuroinflammation. Journal of Experimental Medicine 220 (2023)

Paolicelli, R. C.; Sierra, A.; Stevens, B.; Tremblay, M. E.; Aguzzi, A.; Ajami, B.; Amit, I.; Audinat, E.; Bechmann, I.; Bennett, M. et al.; Bennett, F.; Bessis, A.; Biber, K.; Bilbo, S.; Blurton-Jones, M.; Boddeke, E.; Brites, D.; Brone, B.; Brown, G. C.; Butovsky, O.; Carson, M. J.; Castellano, B.; Colonna, M.; Cowley, S. A.; Cunningham, C.; Davalos, D.; De Jager, P. L.; de Strooper, B.; Denes, A.; Eggen, B. J. L.; Eyo, U.; Galea, E.; Garel, S.; Ginhoux, F.; Glass, C. K.; Gokce, O.; Gomez-Nicola, D.; Gonzalez, B.; Gordon, S.; Graeber, M. B.; Greenhalgh, A. D.; Gressens, P.; Greter, M.; Gutmann, D. H.; Haass, C.; Heneka, M. T.; Heppner, F. L.; Hong, S.; Hume, D. A.; Jung, S.; Kettenmann, H.; Kipnis, J.; Koyama, R.; Lemke, G.; Lynch, M.; Majewska, A.; Malcangio, M.; Malm, T.; Mancuso, R.; Masuda, T.; Matteoli, M.; McColl, B. W.; Miron, V. E.; Molofsky, A. V.; Monje, M.; Mracsko, E.; Nadjar, A.; Neher, J. J.; Neniskyte, U.; Neumann, H.; Noda, M.; Peng, B.; Peri, F.; Perry, V. H.; Popovich, P. G.; Pridans, C.; Priller, J.; Prinz, M.; Ragozzino, D.; Ransohoff, R. M.; Salter, M. W.; Schaefer, A.; Schafer, D. P.; Schwartz, M.; Simons, M.; Smith, C. J.; Streit, W. J.; Tay, T. L.; Tsai, L. H.; Verkhratsky, A.; von Bernhardi, R.; Wake, H.; Wittamer, V.; Wolf, S. A.; Wu, L. J.; Wyss-Coray, T.: Microglia states and nomenclature: A field at its crossroads. Neuron 110 (21), pp. 3458 - 3483 (2022)

Badimon, A.; Strasburger, H. J.; Ayata, P.; Chen, X.; Nair, A.; Ikegami, A.; Hwang, P.; Chan, A. T.; Graves, S. M.; Uweru, J. O. et al.; Ledderose, C.; Kutlu, M. G.; Wheeler, M. A.; Kahan, A.; Ishikawa, M.; Wang, Y. C.; Loh, Y. E.; Jiang, J. X.; Surmeier, D. J.; Robson, S. C.; Junger, W. G.; Sebra, R.; Calipari, E. S.; Kenny, P. J.; Eyo, U. B.; Colonna, M.; Quintana, F. J.; Wake, H.; Gradinaru, V.; Schaefer, A.: Negative feedback control of neuronal activity by microglia. Nature 586 (7829), pp. 417 - 423 (2020)

Gunner, G.; Cheadle, L.; Johnson, K. M.; Ayata, P.; Badimon, A.; Mondo, E.; Nagy, M. A.; Liu, L.; Bemiller, S. M.; Kim, K. W. et al.; Lira, S. A.; Lamb, B. T.; Tapper, A. R.; Ransohoff, R. M.; Greenberg, M. E.; Schaefer, A.; Schafer, D. P.: Sensory lesioning induces microglial synapse elimination via ADAM10 and fractalkine signaling. Nat Neurosci 22 (7), pp. 1075 - 1088 (2019)

Ayata, P.; Badimon, A.; Strasburger, H. J.; Duff, M. K.; Montgomery, S. E.; Loh, Y. E.; Ebert, A.; Pimenova, A. A.; Ramirez, B. R.; Chan, A. T. et al.; Sullivan, J. M.; Purushothaman, I.; Scarpa, J. R.; Goate, A. M.; Busslinger, M.; Shen, L.; Losic, B.; Schaefer, A.: Epigenetic regulation of brain region-specific microglia clearance activity. Nat Neurosci 21 (8), pp. 1049 - 1060 (2018)

von Schimmelmann, M.; Feinberg, P. A.; Sullivan, J. M.; Ku, S. M.; Badimon, A.; Duff, M. K.; Wang, Z.; Lachmann, A.; Dewell, S.; Ma'ayan, A. et al.; Han, M. H.; Tarakhovsky, A.; Schaefer, A.: Polycomb repressive complex 2 (PRC2) silences genes responsible for neurodegeneration. Nat Neurosci 19 (10), pp. 1321 - 30 (2016)

Tan, C. L.; Plotkin, J. L.; Veno, M. T.; von Schimmelmann, M.; Feinberg, P.; Mann, S.; Handler, A.; Kjems, J.; Surmeier, D. J.; O'Carroll, D. et al.; Greengard, P.; Schaefer, A.: MicroRNA-128 governs neuronal excitability and motor behavior in mice. Science 342 (6163), pp. 1254 - 8 (2013)