FACS & Imaging Core Facility 

Journal Article (45)

2021
Journal Article
Boehm, U.; Nelson, G.; Brown, C. M.; Bagley, S.; Bajcsy, P.; Bischof, J.; Dauphin, A.; Dobbie, I. M.; Eriksson, J. E.; Faklaris, O. et al.; Fernandez-Rodriguez, J.; Ferrand, A.; Gelman, L.; Gheisari, A.; Hartmann, H.; Kukat, C.; Laude, A.; Mitkovski, M.; Munck, S.; North, A. J.; Rasse, T. M.; Resch-Genger, U.; Schuetz, L. C.; Seitz, A.; Strambio-De-Castillia, C.; Swedlow, J. R.; Nitschke, R.: QUAREP-LiMi: a community endeavor to advance quality assessment and reproducibility in light microscopy. Nat Methods 18 (12), pp. 1423 - 1426 (2021)
Journal Article
Damen, M.; Wirtz, L.; Soroka, E.; Khatif, H.; Kukat, C.; Simons, B. D.; Bazzi, H.: High proliferation and delamination during skin epidermal stratification. Nature Communications 12 (1), p. 3227 (2021)
Journal Article
Pouikli, A.; Parekh, S.; Maleszewska, M.; Nikopoulou, C.; Baghdadi, M.; Tripodi, I.; Folz-Donahue, K.; Hinze, Y.; Mesaros, A.; Hoey, D. et al.; Giavalisco, P.; Dowell, R.; Partridge, L.; Tessarz, P.: Chromatin remodeling due to degradation of citrate carrier impairs osteogenesis of aged mesenchymal stem cells. Nature Aging 1 (9), pp. 810 - 825 (2021)
2020
Journal Article
Campoy, J. A.; Sun, H.; Goel, M.; Jiao, W. B.; Folz-Donahue, K.; Wang, N.; Rubio, M.; Liu, C.; Kukat, C.; Ruiz, D. et al.; Huettel, B.; Schneeberger, K.: Gamete binning: chromosome-level and haplotype-resolved genome assembly enabled by high-throughput single-cell sequencing of gamete genomes. Genome Biol 21 (1), p. 306 (2020)
Journal Article
Motori, E.; Atanassov, I.; Kochan, S. M. V.; Folz-Donahue, K.; Sakthivelu, V.; Giavalisco, P.; Toni, N.; Puyal, J.; Larsson, N.G.: Neuronal metabolic rewiring promotes resilience to neurodegeneration caused by mitochondrial dysfunction. Sci Adv 6 (35), p. eaba8271 (2020)
Journal Article
Dietzel, S.; Ferrando-May, E.; Fried, H.; Kukat, C.; Naumann, A.; Nitschke, R.; Pasierbek, P.; Peychl, J.; Rasse, T. M.; Schroth-Diez, B. et al.; Stockl, M. T.; Terjung, S.; Thuenauer, R.; Tulok, S.; Weidtkamp-Peters, S.; German BioImaging-Society for, M.; Image, A.: A Joint Action in Times of Pandemic: The German BioImaging Recommendations for Operating Imaging Core Facilities During the SARS-Cov-2 Emergency. Cytometry A 9 (97), pp. 882 - 886 (2020)
Journal Article
Jiang, H.; Gallet, S.; Klemm, P.; Scholl, P.; Folz-Donahue, K.; Altmuller, J.; Alber, J.; Heilinger, C.; Kukat, C.; Loyens, A. et al.; Muller-Fielitz, H.; Sundaram, S.; Schwaninger, M.; Prevot, V.; Bruning, J. C.: MCH Neurons Regulate Permeability of the Median Eminence Barrier. Neuron 2 (107), pp. 205 - 207 (2020)
Journal Article
Kramer, M.; Plum, P. S.; Velazquez Camacho, O.; Folz-Donahue, K.; Thelen, M.; Garcia-Marquez, I.; Wolwer, C.; Busker, S.; Wittig, J.; Franitza, M. et al.; Altmuller, J.; Loser, H.; Schlosser, H.; Buttner, R.; Schroder, W.; Bruns, C. J.; Alakus, H.; Quaas, A.; Chon, S. H.; Hillmer, A. M.: Cell type-specific transcriptomics of esophageal adenocarcinoma as a scalable alternative for single cell transcriptomics. Mol Oncol 14 (6), pp. 1170 - 1184 (2020)
Journal Article
Goebel, J.; Engelhardt, E.; Pelzer, P.; Sakthivelu, V.; Jahn, H. M.; Jevtic, M.; Folz-Donahue, K.; Kukat, C.; Schauss, A.; Frese, C. K. et al.; Giavalisco, P.; Ghanem, A.; Conzelmann, K. K.; Motori, E.; Bergami, M.: Mitochondria-Endoplasmic Reticulum Contacts in Reactive Astrocytes Promote Vascular Remodeling. Cell Metab 31 (4), pp. 791 - 808 e8 (2020)
2019
Journal Article
Cossarizza, A.; Chang, H. D.; Radbruch, A.; Acs, A.; Adam, D.; Adam-Klages, S.; Agace, W. W.; Aghaeepour, N.; Akdis, M.; Allez, M. et al.; Almeida, L. N.; Alvisi, G.; Anderson, G.; Andra, I.; Annunziato, F.; Anselmo, A.; Bacher, P.; Baldari, C. T.; Bari, S.; Barnaba, V.; Barros-Martins, J.; Battistini, L.; Bauer, W.; Baumgart, S.; Baumgarth, N.; Baumjohann, D.; Baying, B.; Bebawy, M.; Becher, B.; Beisker, W.; Benes, V.; Beyaert, R.; Blanco, A.; Boardman, D. A.; Bogdan, C.; Borger, J. G.; Borsellino, G.; Boulais, P. E.; Bradford, J. A.; Brenner, D.; Brinkman, R. R.; Brooks, A. E. S.; Busch, D. H.; Buscher, M.; Bushnell, T. P.; Calzetti, F.; Cameron, G.; Cammarata, I.; Cao, X.; Cardell, S. L.; Casola, S.; Cassatella, M. A.; Cavani, A.; Celada, A.; Chatenoud, L.; Chattopadhyay, P. K.; Chow, S.; Christakou, E.; Cicin-Sain, L.; Clerici, M.; Colombo, F. S.; Cook, L.; Cooke, A.; Cooper, A. M.; Corbett, A. J.; Cosma, A.; Cosmi, L.; Coulie, P. G.; Cumano, A.; Cvetkovic, L.; Dang, V. D.; Dang-Heine, C.; Davey, M. S.; Davies, D.; De Biasi, S.; Del Zotto, G.; Dela Cruz, G. V.; Delacher, M.; Della Bella, S.; Dellabona, P.; Deniz, G.; Dessing, M.; Di Santo, J. P.; Diefenbach, A.; Dieli, F.; Dolf, A.; Dorner, T.; Dress, R. J.; Dudziak, D.; Dustin, M.; Dutertre, C. A.; Ebner, F.; Eckle, S. B. G.; Edinger, M.; Eede, P.; Ehrhardt, G. R. A.; Eich, M.; Engel, P.; Engelhardt, B.; Erdei, A.; Esser, C.; Everts, B.; Evrard, M.; Falk, C. S.; Fehniger, T. A.; Felipo-Benavent, M.; Ferry, H.; Feuerer, M.; Filby, A.; Filkor, K.; Fillatreau, S.; Follo, M.; Forster, I.; Foster, J.; Foulds, G. A.; Frehse, B.; Frenette, P. S.; Frischbutter, S.; Fritzsche, W.; Galbraith, D. W.; Gangaev, A.; Garbi, N.; Gaudilliere, B.; Gazzinelli, R. T.; Geginat, J.; Gerner, W.; Gherardin, N. A.; Ghoreschi, K.; Gibellini, L.; Ginhoux, F.; Goda, K.; Godfrey, D. I.; Goettlinger, C.; Gonzalez-Navajas, J. M.; Goodyear, C. S.; Gori, A.; Grogan, J. L.; Grummitt, D.; Grutzkau, A.; Haftmann, C.; Hahn, J.; Hammad, H.; Hammerling, G.; Hansmann, L.; Hansson, G.; Harpur, C. M.; Hartmann, S.; Hauser, A.; Hauser, A. E.; Haviland, D. L.; Hedley, D.; Hernandez, D. C.; Herrera, G.; Herrmann, M.; Hess, C.; Hofer, T.; Hoffmann, P.; Hogquist, K.; Holland, T.; Hollt, T.; Holmdahl, R.; Hombrink, P.; Houston, J. P.; Hoyer, B. F.; Huang, B.; Huang, F. P.; Huber, J. E.; Huehn, J.; Hundemer, M.; Hunter, C. A.; Hwang, W. Y. K.; Iannone, A.; Ingelfinger, F.; Ivison, S. M.; Jack, H. M.; Jani, P. K.; Javega, B.; Jonjic, S.; Kaiser, T.; Kalina, T.; Kamradt, T.; Kaufmann, S. H. E.; Keller, B.; Ketelaars, S. L. C.; Khalilnezhad, A.; Khan, S.; Kisielow, J.; Klenerman, P.; Knopf, J.; Koay, H. F.; Kobow, K.; Kolls, J. K.; Kong, W. T.; Kopf, M.; Korn, T.; Kriegsmann, K.; Kristyanto, H.; Kroneis, T.; Krueger, A.; Kuhne, J.; Kukat, C.; Yazdanbakhsh, M.; Yu, L.; Yue, A.; Zhang, H.; Zhao, Y.; Ziegler, S. M.; Zielinski, C.; Zimmermann, J.; Zychlinsky, A.: Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (second edition). Eur J Immunol 49 (10), pp. 1457 - 1973 (2019)
Journal Article
Collmann, F. M.; Pijnenburg, R.; Hamzei-Taj, S.; Minassian, A.; Folz-Donahue, K.; Kukat, C.; Aswendt, M.; Hoehn, M.: Individual in vivo Profiles of Microglia Polarization After Stroke, Represented by the Genes iNOS and Ym1. Front Immunol 10, p. 1236 (2019)
Journal Article
Czechowska, K.; Lannigan, J.; Wang, L.; Arcidiacono, J.; Ashhurst, T. M.; Barnard, R. M.; Bauer, S.; Bispo, C.; Bonilla, D. L.; Brinkman, R. R. et al.; Cabanski, M.; Chang, H. D.; Chakrabarti, L.; Chojnowski, G.; Cotleur, B.; Degheidy, H.; Dela Cruz, G. V.; Eck, S.; Elliott, J.; Errington, R.; Filby, A.; Gagnon, D.; Gardner, R.; Green, C.; Gregory, M.; Groves, C. J.; Hall, C.; Hammes, F.; Hedrick, M.; Hoffman, R.; Icha, J.; Ivaska, J.; Jenner, D. C.; Jones, D.; Kerckhof, F. M.; Kukat, C.; Lanham, D.; Leavesley, S.; Lee, M.; Lin-Gibson, S.; Litwin, V.; Liu, Y.; Molloy, J.; Moore, J. S.; Muller, S.; Nedbal, J.; Niesner, R.; Nitta, N.; Ohlsson-Wilhelm, B.; Paul, N. E.; Perfetto, S.; Portat, Z.; Props, R.; Radtke, S.; Rayanki, R.; Rieger, A.; Rogers, S.; Rubbens, P.; Salomon, R.; Schiemann, M.; Sharpe, J.; Sonder, S. U.; Stewart, J. J.; Sun, Y.; Ulrich, H.; Van Isterdael, G.; Vitaliti, A.; van Vreden, C.; Weber, M.; Zimmermann, J.; Vacca, G.; Wallace, P.; Tarnok, A.: Cyt-Geist: Current and Future Challenges in Cytometry: Reports of the CYTO 2018 Conference Workshops. Cytometry A 95 (6), pp. 598 - 644 (2019)
Journal Article
Vogel, S.; Schafer, C.; Hess, S.; Folz-Donahue, K.; Nelles, M.; Minassian, A.; Schwarz, M. K.; Kukat, C.; Ehrlich, M.; Zaehres, H. et al.; Kloppenburg, P.; Hoehn, M.; Aswendt, M.: The in vivo timeline of differentiation of engrafted human neural progenitor cells. Stem Cell Res 37, p. 101429 (2019)
Journal Article
Baumgart, J.; Kirchner, M.; Redemann, S.; Bond, A.; Woodruff, J.; Verbavatz, J.-M.; Jülicher, F.; Müller-Reichert, T.; Hyman, A. A.; Brugués, J.: Soluble tubulin is significantly enriched at mitotic centrosomes. Journal of Cell Biology 218, pp. 3977 - 3985 (2019)
Journal Article
Galvin, A.; Weglarz, M.; Folz-Donahue, K.; Handley, M.; Baum, M.; Mazzola, M.; Litwa, H.; Scadden, D. T.; Silberstein, L.: Cell Cycle Analysis of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells by Multicolor Flow Cytometry. Curr Protoc Cytom 87 (1), p. e50 (2019)
2018
Journal Article
Kauppila, J. H. K.; Bonekamp, N.; Mourier, A.; Isokallio, M.; Just, A.; Kauppila, T.; Stewart, J.; Larsson, N.G.: Base-excision repair deficiency alone or combined with increased oxidative stress does not increase mtDNA point mutations in mice. Nucleic Acids Res 46 (13), pp. 6642 - 6669 (2018)
2016
Journal Article
Ferrando-May, E.; Hartmann, H.; Reymann, J.; Ansari, N.; Utz, N.; Fried, H. U.; Kukat, C.; Peychl, J.; Liebig, C.; Terjung, S. et al.; Laketa, V.; Sporbert, A.; Weidtkamp-Peters, S.; Schauss, A.; Zuschratter, W.; Avilov, S.; German BioImaging, n.: Advanced light microscopy core facilities: Balancing service, science and career. Microsc Res Tech 79 (6), pp. 463 - 79 (2016)
2015
Journal Article
Kukat, C.; Davies, K. M.; Wurm, C. A.; Spahr, H.; Bonekamp, N. A.; Kühl, I.; Joos, F.; Polosa, P. L.; Park, C. B.; Posse, V. et al.; Falkenberg, M.; Jakobs, S.; Kuhlbrandt, W.; Larsson, N.G.: Cross-strand binding of TFAM to a single mtDNA molecule forms the mitochondrial nucleoid. Proc Natl Acad Sci U S A 112 (36), pp. 11288 - 93 (2015)
Journal Article
Lagouge, M.; Mourier, A.; Lee, H.J.; Spahr, H.; Wai , T.; Kukat, C.; Ramos, E.S.; Motori, E.; Busch, J. D.; Siira, S. et al.; Kremmer, E.; Filipovska, A.; Larsson, N.G.: SLIRP Regulates the Rate of Mitochondrial Protein Synthesis and Protects LRPPRC from Degradation. PLoS Genet 11 (8), p. e1005423 (2015)
2014
Journal Article
Baggio, F.; Bratic, A.; Mourier, A.; Kauppila, T. E. S.; Tain, L. S.; Kukat, C.; Habermann, B.H.; Partridge, L.; Larsson, N.G.: Drosophila melanogaster LRPPRC2 is involved in coordination of mitochondrial translation. Nucleic Acids Res 42 (22), pp. 13920 - 38 (2014)
Go to Editor View